科学探索|研究发现被认为是基因表达关键的结构更具活力但寿命更短( 二 )
Brand?o表示:“在这项研究中 , 通过将我们的实验数据跟聚合物模拟相结合 , 我们现在已经能量化未环形、部分挤压和完全环形状态的相对程度 。”
Gabriele则补充道:“由于这些相互作用非常短但非常频繁 , 所以以前的方法无法完全捕捉它们的动态 。通过我们的新技术 , 我们可以开始解决完全环路和非环路状态之间的过渡 。”
研究人员假设 , 这些部分环路可能在基因调控中比完全形成的环路发挥更重要的作用 。当环路开始形成然后散开时 , DNA链相互运行 , 而这些相互作用可能有助于调节元素 , 如增强子和基因启动子找到对方 。
“90%以上的时间都有一些瞬时的环路 , 据推测 , 重要的是有那些正在被永久挤压的环路 。挤压的过程本身可能比只在短时间内出现的完全环路状态更重要 , ”Gabriele说道 。
更多的环路需要研究
由于基因组中的大多数其他环路比研究人员在本文中研究的环路更弱 , 所以他们怀疑许多其他环路也将被证明是高度短暂的 。现在 , 他们计划使用他们的新技术在各种细胞类型中研究其中一些其他环路 。
Hansen说道:“约有一万个这样的环路 , 而我们已经看了一个 。我们有很多间接证据表明 , 这些结果将是可推广的 , 但我们还没有证明这点 。使用我们建立的技术平台并结合新的实验和计算方法 , 我们可以开始接近基因组中的其他环路 。”
【科学探索|研究发现被认为是基因表达关键的结构更具活力但寿命更短】此外 , 研究人员还计划调查特定环路在疾病中的作用 。许多疾病--包括一种叫做FOXG1综合征的神经发育障碍都可能跟错误的环路动态有关 。研究人员现在正在研究FOXG1基因的正常和突变形式及致癌基因MYC是如何被基因组环路形成影响的 。
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