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市场上八成木瓜是转基因食品 。检测结果显示,各地所销售的国产木瓜几乎全部含有两种抗生素抗性基因:卡那霉素抗性基因(nptII)和四环素抗性基因(tetR) 。中国农业大学食品科学与营养工程学院专家称，环斑病毒对于木瓜是毁灭性的灾害 ， 几乎都要用到转基因技术来抗击这个病毒，让木瓜产生抗性 。所以木瓜如果不是转基因，就基本没有收成 。由于转基因木瓜全世界范围内普遍种植，因此标不标识都不影响 。
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